Theo cơ cấu tổ chức được phê duyệt, Ban quản lý rừng phòng hộ Núi Cậu Dầu Tiếng gồm có Ban Lãnh đạo và các phòng chuyên môn, trong đó:

1. Ban lãnh đạo

Có Giám đốc và không quá 02 Phó Giám đốc.

2. Các phòng chuyên môn

- Phòng Hành chính - Kế hoạch -Tài chính.

- Phòng Kỹ thuật.

- Phòng Quản lý bảo vệ rừng.